Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa35E9QLQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Defa35E9QLQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Defa35E9QLQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Defa35E9QLQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa35E9QLQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa35E9QLQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms