Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11cB4XVP9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms