Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFG3L2Q9Y4W6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms