Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rpusd4Q9CWX4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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