Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms