Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP4Q96P64 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms