Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG3Q96JB2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG3Q96JB2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms