Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF248Q8NDW4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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