Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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