Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms