Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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