Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms