Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2CP19387 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms