Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFTRP13569 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFTRP13569 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFTRP13569 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms