Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms