Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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