Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP35Q9P2H5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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