Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCDC88CQ9P219 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCDC88CQ9P219 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCDC88CQ9P219 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCDC88CQ9P219 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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