Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms