Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBQLN4Q9NRR5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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