Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms