Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM41Q8WV44 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms