Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dkk4Q8VEJ3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dkk4Q8VEJ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms