Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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