Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD1Q13393 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms