Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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