Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms