Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKD1P98161 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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