Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms