Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAV1P15498 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAV1P15498 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms