Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX7O95931 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX7O95931 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX7O95931 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms