Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DIRC3C9JPN6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms