Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms