Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms