Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PBRM1Q86U86 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms