Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALFQ53S48 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms