Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms