Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PKD1P98161 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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