Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms