Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGCXP38435 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms