Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms