Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR3P22607 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms