Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBNO2Q9Y2G9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms