Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms