Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM41Q8WV44 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms