Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms