Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITRM1Q5JRX3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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