Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms