Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms