Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXE3Q13461 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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FOXE3Q13461 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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FOXE3Q13461 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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